MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Xanthomonas albilineans GPE PC73 plasmid plasmIII

Total Repeats: 94

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017555	TGC	2	6	1878	1883	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_017555	ATGT	2	8	1950	1957	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017555	T	7	7	1978	1984	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017555	T	6	6	2017	2022	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017555	ACTGC	2	10	2072	2081	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
6	NC_017555	TCT	2	6	2095	2100	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_017555	GCT	3	9	2136	2144	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_017555	GAA	2	6	2148	2153	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017555	T	6	6	2888	2893	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017555	GCC	2	6	2962	2967	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11	NC_017555	TTTC	2	8	2998	3005	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
12	NC_017555	TTC	2	6	3026	3031	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_017555	GAA	2	6	3040	3045	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017555	GTA	2	6	3056	3061	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15	NC_017555	GCA	2	6	3094	3099	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_017555	TGC	2	6	3107	3112	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_017555	TCGT	2	8	3144	3151	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
18	NC_017555	CGA	2	6	3155	3160	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_017555	TTA	2	6	3176	3181	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017555	CGG	2	6	3785	3790	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_017555	GC	3	6	3791	3796	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
22	NC_017555	GC	4	8	3823	3830	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
23	NC_017555	GCA	2	6	3901	3906	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_017555	GC	6	12	4742	4753	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
25	NC_017555	CTA	2	6	4788	4793	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_017555	GAAA	2	8	4796	4803	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
27	NC_017555	TAAA	2	8	5773	5780	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_017555	CAAA	2	8	5781	5788	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
29	NC_017555	TAA	2	6	5790	5795	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017555	GGT	2	6	5838	5843	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
31	NC_017555	CAG	2	6	5885	5890	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_017555	CG	3	6	6517	6522	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
33	NC_017555	CAT	2	6	6529	6534	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_017555	TCA	2	6	7044	7049	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_017555	CAT	2	6	7084	7089	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_017555	CGG	2	6	7104	7109	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_017555	CGC	2	6	7119	7124	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
38	NC_017555	AGC	3	9	7182	7190	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_017555	GTC	2	6	7214	7219	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_017555	CTG	2	6	7249	7254	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_017555	GGA	2	6	7301	7306	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
42	NC_017555	AGC	2	6	8055	8060	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_017555	A	6	6	9128	9133	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_017555	GCTG	2	8	9134	9141	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
45	NC_017555	AGC	2	6	9146	9151	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_017555	GCTT	2	8	13319	13326	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
47	NC_017555	AGC	2	6	16393	16398	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_017555	GCA	2	6	16411	16416	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_017555	CAAA	2	8	17520	17527	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
50	NC_017555	CAA	2	6	17566	17571	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_017555	TGC	2	6	17594	17599	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_017555	G	8	8	17600	17607	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
53	NC_017555	TTTC	2	8	18872	18879	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
54	NC_017555	CGC	2	6	23048	23053	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
55	NC_017555	CAA	2	6	23095	23100	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_017555	A	6	6	23116	23121	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_017555	TAT	2	6	23139	23144	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_017555	GCG	2	6	23589	23594	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_017555	GGC	2	6	23611	23616	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_017555	GGGA	2	8	23656	23663	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
61	NC_017555	CTG	2	6	24603	24608	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_017555	AACG	2	8	24616	24623	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
63	NC_017555	ATG	2	6	24635	24640	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
64	NC_017555	AAT	2	6	24641	24646	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_017555	TAAA	2	8	24662	24669	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_017555	AGA	2	6	24684	24689	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
67	NC_017555	CGG	2	6	24750	24755	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_017555	GCG	2	6	24922	24927	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_017555	CGA	3	9	24939	24947	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_017555	TGCCG	2	10	24981	24990	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
71	NC_017555	CG	3	6	25003	25008	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
72	NC_017555	GAT	2	6	25097	25102	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
73	NC_017555	TCGC	2	8	25119	25126	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
74	NC_017555	GTT	2	6	25180	25185	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
75	NC_017555	GCT	2	6	25191	25196	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_017555	GTT	2	6	25203	25208	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
77	NC_017555	CG	3	6	25223	25228	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
78	NC_017555	CGT	2	6	25263	25268	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_017555	TAG	2	6	25286	25291	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
80	NC_017555	TGG	2	6	25308	25313	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
81	NC_017555	GGA	2	6	25333	25338	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
82	NC_017555	A	6	6	26291	26296	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_017555	T	6	6	26299	26304	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_017555	ACC	2	6	26359	26364	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
85	NC_017555	TCC	2	6	26383	26388	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
86	NC_017555	AGCAA	2	10	26400	26409	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
87	NC_017555	CCG	2	6	26444	26449	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
88	NC_017555	CG	3	6	26458	26463	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
89	NC_017555	GC	3	6	26467	26472	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
90	NC_017555	CCCG	2	8	26501	26508	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
91	NC_017555	CGC	2	6	26537	26542	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
92	NC_017555	CTA	2	6	26594	26599	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
93	NC_017555	ACT	2	6	26613	26618	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
94	NC_017555	GAAA	2	8	26659	26666	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.